Profile

   アブシジン酸を中心にして、植物を語ってみたい。幾分変人と評されることの多い著者が書くものであるから、一般的なアブシジン酸の理解とは可成りな違いがある。説の正否はもちろん大事だが、どのような視座からものを見たのかという点で楽しんで頂ければそれで良い。さて、人が他人の書いたものをある程度でも理解しようとする場合、著者の育ち、経歴、社会における立ち位置などをある程度知っておいたほうが良いだろう。文体と論理の明晰さだけから、女性である著者を男性に違いないと長い間誤解していた経験があるが、これは希有な例外であって、こんなことはまず起こらない。同時代のすべての人から全く理解してもらえないほどの天才(別名を気違いという)ではない著者が書くものであれば、そこで提示される発想が著者の人となりから大きく乖離する場合はほとんどないだろう。とすれば、恥ずかしながらも私自身について、ある程度のプロフィールを書いておくほうがいいのかなと思い書くことにする。

  幼い頃から体が弱く、幼稚園には半分ほどしか行けなかったらしい。体の発達とともに知能の発達も遅かったらしく、私には幼稚園の記憶はもとより小学校と中学校の記憶さえほとんど残っていない。早生まれの一人っ子で、かつ父の仕事ゆえにほぼ1年ごとの転居をくり返していた私には、社会性はほとんど育っておらず、人間関係は疲れるだけのものであったような気がする。私の中で、記憶がつながりとして残ってくるのは高校の頃からである。それ以前は、いくつかの断片的な記憶が残っているだけで、いわば他人の人生のように感じている。どうもこれは私に特有な症状のように思える。幼いときからの細かな記憶を保持している人を時々見かけるが、こんな人は生まれてから転居することなく育った人に多いようだ。

  彼らは、一本の木、いつも通る道、良く出会う人、いつも見る町並みなど、そういう何でもないものを見る度に、記憶をたどり再確認する作業をしているのではないだろうか。免疫におけるブースター効果みたいなものだろう。これがなかった私は、幼年時代の記憶をほとんど失って、現実の故郷だけでなく,精神的な郷里をも失った異邦人のような存在になっている。従って、先に書いた幼稚園に行けなかったという話も、93歳で他界した母親の昔話にすぎない。いわゆる虚弱児童であった私は、虫の図鑑をみながら日々を過ごしていたという。昭和30年頃の図鑑であるから印刷は悪かったであろうし、それほど立派なものであったとは思えないが、不思議で煌びやかなチョウの斑紋に、奇妙な甲虫の形と輝きに心ときめかせたのであろう。記憶は定かでないが、人並みに昆虫採集をはじめたことがあった。しかし、死にかけたギンヤンマの最後の痙攣をみて号泣し、採集を止めてしまった。まだ感受性が高かった頃の話である。

  小学1年のときの唯一ともいえるエピソードだが(本人の記憶はない)、先生がスジグロシロチョウを教室に持ってきてモンシロチョウですよと教えたらしい。ところが、低能なはずの私が、違う!それはスジグロシロチョウであると言い張ったという。体は弱く、人付き合いもできず、手がかかるだけだったこのガキの行為は、反抗として受け取られたらしく、転校するまで数ヶ月ほど干されたそうだ。何度も母親から聞かされた故にいかにも覚えているような気がするが、本人は具体的な記憶を全く持ち合わせていない。

  この世では言ってはいけない事があることを、初めて知ったのがこの時であったのだろう。だが還暦を過ぎても、この手の失敗を続けている。正論を盾に、何度辞表を書いたことか?「智に働いて角を立て、意地を通して失職し、余り豊かじゃない暮らし、其れがあなたの生きる道」などと誉められながら暮らしている。生来の性格に対して、学習などというものが殆ど役には立たないと実感するこの頃である。

  さて、私が中学3年か高校1年、今から50年程前のことである。まだ品格を残していたNHKだったと思うが、フランスの科学者がアマゾン川流域に生える幻のキノコを、実験室で栽培し、その幻覚成分を突き止めたというラジオ番組があった。この放送に触発された私は、昆虫だけではなく毒キノコにものめり込み、将来は天然物化学の研究者になろうと決意した。こうした番組を作るヒトは、子供の運命を変えてしまう可能性を持つことを誇りに思って良いかもしれないが、その怖さをも自覚する必要があるだろう。

  この決意を持って年に一度の転居を重ねながら高校性となったわけだが、ここで大きな挫折を味わうことになる。同じクラスの友人が極めてよくできる奴で、特に数学の能力は抜きんでていた。当時、旺文社が実施していた全国模試で二桁に入るような男で、高校1年のときにブルバキの数学原論を原書で読んでいた。(後日これは、誤解であることが判明した。原書ではなく、英語への翻訳本であった) これに対し、当時の私の数学能力はかなり悲惨であった。当時、小・中学校の教科書は、単元の順序が出版社によってまちまちであったため、毎年の転校ごとに未習単元を積み重ねていたのである。正の数と負の数の概念があやふやで且つ因数分解の意味も分からずにうろうろしていた私は、ブルバキの彼と自らを比較し、人知れず劣等感にひたる毎日を過ごしていたのである。

  ところがある日、自分の持つ思いもよらぬ能力に気づいた。目の見えない人に鋭敏な聴覚や触覚が育つように、数学のできない私には化学構造式が何の苦労もなく覚えられるのである。虫や鳥や植物の形に集中してきた私には、化学構造式をいくつかのピースの組み合わせとして捉える訓練ができていたのかもしれない。これは、天然物化学を志向する私にとって最高の贈り物であった。私も彼に倣って大学用の有機化学の教科書を、理解もできないままに読みふけったものである。

  まあ当然ではあるが、人生がそう思い通りにゆくものではない。16歳のとき、4月に引いた風邪からチアノーゼを引き起こすような喘息を患い、7ヶ月ほど寝たきりに近い生活を余儀なくされた。成績は急降下、進学どころか進級さえも危ないという状況に陥った。この体で将来どうやって生きていこうかと悩まざるを得ない日々ではあったが、同時に病のもたらす独特の精神状態を楽しんだのも間違いない。堀辰雄の作品にひたり、立原道造の13行詩を読みふけった。身近に死の影を感じ、その影を恐れながらも、夭折とか病葉という言葉に憧れと共感を感じていた。病の原因は肉体的なものではなく、多分に精神的なものであったようだ。内容については余りに私的なことなので省くことにするが、要するに子供であったということだろう。原因に気づいた日から急速に回復し、それ以降無謀な生活を続けてきたが、まだ元気に暮らしている。

  その年の12月に高校へ復帰した後、担任と校長の温情でなんとか進級した。成績も順調に回復したため自信を持って大学の入試に臨んだのだが、入試の前日、憧れの博多でパチンコ屋にデビューした。宿泊した旅館で友人たちと少しだけ酒を飲み、朝の四時近くまで騒いだ。実に馬鹿である。次の日の1時間目、国語の試験問題を一問解いたところで耐え難い睡魔におそわれ、ちょっとだけと思って寝た。肩をつつかれて目覚めると解答用紙の回収中である。よだれでまだ湿っているほぼ空白の解答用紙を恥ずかしながらも提出した。立ち上る淡い水蒸気を見たような記憶が残っている。もっと早く起こしてくれよと思ったが後の祭り、後日、一方通行の道路の出口で警官に捕まったとき、よく似た気持ちがした。もちろん落ちた。同じ部屋の友人達も皆落ちた。他の科目の得点は悪くなかったので、次の年は絶対大丈夫だと浪人の道を選んだのだが、ここでもまた世の中の厳しさを思い知らされることになる。

  この時代、私の受験した大学の試験科目は英語、数学、国語は当然として、理科と社会それぞれ2科目ずつ必要で、かつ大学からの科目指定であった。そして、最初に受験した年の指定科目は−世界史、人文地理、化学、生物—であったのに、なんと次の年6月には−日本史、倫理社会、物理、地学−が指定された。ちょっとだけ頭を抱えた。人間万事塞翁が馬、今振り返ってみると、この8科目を試験科目としたことが、いま考えを進める上で重要な基礎をなしているように感じている。

  大学4年になって研究室に配属され、修士課程にかけて菌の代謝産物の構造を2つほど決めて天然物化学から一時手を引くことになる。(これは正しくない、私は言われるままに分離作業をやっただけで、構造を決めたのはT先生である。) 修士課程を終え国家公務員の上級職を蹴ってとある地方自治体に就職したのだが、たまたま試験の成績が良かったばかりに、いわゆるエリートコースに乗せられてしまった。しかし、私にとって、このコースは居心地の良いところではなかった。研究的仕事はほとんどなく、多くの人との顔つなぎばかり、出勤すると机の上には見合いの写真という状況がいやで、本採用になる一週間前に辞表を出した。「おまえに公務員は無理、好きに生きろ」と、私の教育係だったT氏が笑って送り出して頂いたことに今も感謝している。(ところが現在、どうしたわけか公務員に分類される職にいる。)

同期の仲間より2年遅れて博士課程に戻った。天然物化学の研究では、単離した化合物が既知の物質であるというリスクが大きい。2 年も遅れているのだから早く博士号を取りたいというごくごく短絡的かつ近視眼的理由から、イソクマリンと呼ばれる天然物をモデルとした有機合成の仕事をすることにした。この時に、全く意識しなかったとはいえルヌラリン酸との縁ができていたのかもしれない。

  博士課程を修了した後、とある私立大学に籍を置いた。研究費を稼ぐ意味もあって有機リン系化合物・カーバメート系化合物などの合成を15年ほど続けた。しかしながら、天然物化学に対する興味を失っていたわけではない。日々、代謝マップを眺めながら、いわゆる二次代謝について考えることは続けてきた。何故、生物は、特に植物は多種多様な2次代謝物を作るのか?

  科学において「何故」と問うことは、時に致命的である。安易な目的論に陥らないにしても、論文が書けないからである。科学者として飯を食いたいなら、「何故」ではなく「How: どのように」という問題提起をせよと何度も有益なアドバイスを受けた。しかしながら、もって生まれたやっかいな性格というものは変えようがなく、「WHY?  WHY?  WHY?」と問う習性からいまだに抜けきれていない。

  25年程前になるだろうか、バブルといわれる時代に心理的な違和感を感じていた私は、研究対象を大きく変え、植物ホルモンであるアブシジン酸(図1-1)を扱うことにした。

図1-1

図 1-1 アブシジン酸の構造

  社会の在り方についてちょっと立ち止まって考えないとまずいのではないかと思い始めていた私にとって、「ちょっと待てというシグナルとしてのホルモン」という点に親近感を感じたのが原因である。この時、この化合物が私の自然観を変えてしまうようになろうとは夢想だにしなかったが、それから後の人生はこの化合物に振り回されることになる。研究成果は実にささやかで、学会での評価に値するものではないと自覚している。しかしながら、この化合物について考えるという点においては、誰にも負けなかったという自負はある。アブシジン酸について愚直に考え続けた私に、この化合物が垣間見せてくれた世界は、今までの生化学、天然物化学の常識を覆すものであった。団塊世代のまっただ中にいて、心のどこかで世の中の規範と常識に反抗し続けてきた一研究者のモノローグである。

Profile   完

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歴史生物学への誘い アブシジン酸生合成のまとめ 7

  さて、古細菌は35億年昔に少なくともGGPPまでの生合成を完成させていたと書いたが、真正細菌ではどうだろう。古細菌において「膜脂質がテルペン鎖をもつエーテル脂質であるという事実は何に由来するのだろう」と考えたことあったが。真正細菌つまりバクテリアがテルペン類を作るかどうかなど、ほとんど気にした記憶がない。かすかな記憶としては、テルペン構造を含む抗生物質があったよなという程度である。動物に至ってはコレステロールが膜脂質として働いているとか、プレニル化がタンパク質の活性調節に関与しているとか、プレニル化されたRNAがサイトカイニン生合成の原料の一部であるとか、その程度の断片的記憶しかなかった。ところが少し調べてみると、真正細菌においてもテルペン生合成系は十分に発達していたのである。いまは起源の問題を論じているので、系統樹の根っこ近くに位置する好熱性細菌を対象として論じることにする。

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図8-7 超好熱性真性細菌においてテルペン生合成系はどこまで伸びているか

  結果を先に言えば、真正細菌に属する(超)好熱細菌類は非メバロン酸経路を通ってIPPとDMAPPを合成した後、全ての菌がGGPPまでの生合成系をもっていた。さらに、図8-7に示すように、全ての菌がGGPPだけではなくより多くのイソプレンユニットを持つバクトプレニルピロリン酸やオクタプレニルピロリン酸あるいはヘプタプレニルピロリン酸の合成能力を持つ。どうやらユビキノンやテルペノイドキノンと呼ばれる酸化還元において働く補酵素群へ連なる系が存在しているようだ。さらに、グラム陰性で好気的真正細菌であるThermus thermophilusにおいては、リコペンまでの生合成系が成立している。リコペンの一重項酸素消去能はβ-カロテンを上回るという報告がある。Thermus属細菌が好気性を獲得する上で、この化合物は基盤となる役割を果たしたのかもしれない。真正細菌においても、テルペン生合成の歴史は深そうである。

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図8-8 光合成細菌とテルペン生合成系 1

  さらに付け加えるとすれば、シアノバクテリア出現との時間関係だろう。32億年ほど前には、シアノバクテリアがその後の地球環境を方向付ける酸素発生型光合成を完成させていたのだが、それ以前に、嫌気的光合成を行う光合成細菌の仲間が出現していた。と簡単に書ければ楽なのだが、光合成細菌とはなんぞやと考え始めるとこれがまた難しい。昔は緑色硫黄細菌と緑色非硫黄細菌、紅色硫黄細菌と紅色非硫黄細菌を含む紅色細菌に分類されていたが、近年、紅色細菌の方はプロテオバクテリアに属するいくつかのグループに再分類されてしまった。困ったときのKEEG頼りだが、非酸素発生型光合成を行う細菌群について、Anoxygenic photosynthesis をキーワードに検索をかけると、紅色硫黄細菌2属5種、紅色非硫黄細菌4

図8-9 光合成細菌とテルペン生合成系 2
図8-9 光合成細菌とテルペン生合成系 2

属35種、緑色非硫黄細菌1属5種、緑色硫黄細菌1属11種、及びAcidobacteria の1属1種の計57種の細菌がヒットする。この書き方は昔の分類を踏襲しており、私にとってはわかりやすい。こうした、酸素を発生しない光合成を行う細菌においても、テルペン生合成系の発達は著しい。図8-8と図8-9に彼らの持つ経路と生産する化合物群を示している。一連の流れの中にいくつかの特徴が存在する。彼らは光合成のためにバクテリオクロロフィルをもつのだが、そのバクテリオクロロフィルの構成要素であるフィチルピロリン酸については全ての菌が生合成することができる。さらにSpheroidene、Spiroxanthin、 あるいはTetrahydrospiroxanthinの末端に存在するメトキシグループの生合成ルートである。メチル基の給源がS-アデノシルメチオニンであることは自明のこととして、これ等の原料となる水

表8-1-1  光合成細菌の生産するテルペン系化合物
表8-1-1  光合成細菌の生産するテルペン系化合物
表8-1-2  光合成細菌の生産するテルペン系化合物 
表8-1-2  光合成細菌の生産するテルペン系化合物
表8-1-3  光合成細菌の生産するテルペン系化合物
表8-1-3  光合成細菌の生産するテルペン系化合物

酸基をもつ化合物群は、酸化に伴って作られるのではなく、末端の二重結合に対する水の付加反応で作られている。β-カロテンより先の酸素が関与する代謝系を持つ菌は例外的な3種しか存在しない。どうやら光合成細菌のカロテノイド代謝においても、酸素が関与する水酸化は反応は Zeaxanthin への水酸化から開始されるようだ。

  これらの菌において、進化系統樹を描くと、先ず緑色非硫黄細菌、次いで緑色細菌、紅色細菌そしてシアノバクテリアが分岐したという。これらの事実を考慮しながら、各菌の生産する化合物を書きだした結果を、表8-1-1〜3に示す。興味深いことに、これらの酸素を発生を伴わない光合成をする細菌類57種のすべてにおいて、リコペンまでの生合成が成立している。どうやら、彼らにおいても活性酸素の消去系は必要であったと考えて良いだろう。さらに、緑色硫黄細菌と緑色非硫黄細菌の一部では、β-カロテンにまで生合成系が伸長している。嫌気的生物の時代に好気的光合成の準備は着々と進んでいたと考えて良さそうだ。要するに、真正細菌においてもまた、テルペン生合成の歴史はとてつもなく長いのである。

  すこしまとめてみよう。古生物学と呼ばれる学問がある。少し前までの古生物学では、肉眼で見える化石として残ったモノしか扱わなかった。いまでも、一般社会では恐竜やウミユリや三葉虫のいた時代の学問とイメージされている。もちろん、先端を走る研究者が、微化石を追い、遺伝子から生物の起源を追求し、化学化石の微量分析を行っていることは知っている。分析技術の進歩が、これらの探求を可能にしたという形而下学な条件はあったとは言え、先述したリン・マーギュリスが化石で認識できる時代に先行する嫌気的微生物時代の重要性を唱導した功績は大きい。そして、テルペン類の生合成の歴史は、真正細菌においても古細菌においても、嫌気的微生物時代のごく初期にまで遡るのである。もし、アブシジン酸の生合成の原料をβ-カロテンと考えるたとしても、β-カロテンの歴史は30億年をはるかに超えてしまう。生物とは、それ自体が歴史を内包する存在なのであろう。

  さて我々は、息を止めたら苦しいという絶対的な経験に基づく酸素の必要性を実感としているが故に、生物は酸素を使った酸化系(ミトコンドリアにおける酸化的リン酸化反応)を持つことによって、エネルギー危機を乗り越え多様な高等生物へと進化したとする概念は、殆ど抵抗なく受け入れられるようだ。しかし、一般的に高等生物といわれる多細胞生物の仲間の出現に先だって、彼等の生命維持に必要な代謝系—アミノ酸代謝、DNA・RNAの代謝(複製・転写)・翻訳、糖代謝、脂質代謝、補酵素の代謝などは、嫌気的時代に完璧な形で完成されていたのである。生物の持つ代謝系の根幹は嫌気的生物が創り、その修飾が酸素の時代に起こったと考えて良い。

歴史生物学への誘い アブシジン酸生合成のまとめ 8 に続く

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交通事故

事故

  27年近く、片道1時間余りの車通勤をしていた。よくよく考えてみれば、この間に2年以上の間、車に乗り続けていたことになる。9台の車を乗り継いで積算走行距離は130万キロメートルに近い。その間、無事故で走り続けてきたのだが、一昨日の朝、事故を起こしてしまった。交差点とも言えない程度の交差点で、対向してくるタクシーが方向指示器も出さずに車線を越えて突っ込んできた。客が突然右折せよと言ったので、ハンドルを右に切ったというのだが、いい迷惑である。向こうの保険会社が責任割合は1:9でどうですかと言ってきたのだが、納得がいかないと拒否している。社会常識として、交差点内の事故では10:0になるケースはほとんどないことは知っている。だが、すぐにうんというにはちょっと以上の抵抗がある。タクシーに乗っていた若い女性客は、いつの間にか逃げてしまった。車はバンパーがへこんで少し変形した程度だし、乗っていた私には怪我はない。まあ最終的には、小難で済んだと納得するほかないだろう。とはいえ、やっぱりとても気分が悪い。         7/16

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三連水車

7/15

今日の田んぼ
今日の田んぼ(7/15)

  今日も暑い。猛暑、酷暑、炎暑など言い方は色々あるが、靴の上から暑さがしみ込んでくる。毎日、イネの顔を見に行くのだが、大分しっかりしてきたようだ。ちょっと深水気味だったので、止水版を調節して水深を落としてきた。深水状態ではジャンボタニシの食害が酷くなるそうである。とはいえ今のところ、苗の生長は順調である。

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朝倉の3連水車

  帰りに朝倉の3連水車の横を通った。結構有名であるようだが、7時を過ぎた時間では観光客はいない。黙々と動き続ける水車に意識が有るとすれば、ホッとした自分の時間であるのかもしれない。この水車で水位を1.5 Mくらい上げているのだが、その灌漑面積は13.5 haに上るそうだ。この水車の横には2連水車が2基設置され、3基の水車が潤す大地は35haに上るという。200年以上前に作られたものが、いまも風景に溶け込んで稼働している姿は、現代文明の対極に位置するものである。我々の、目先の金儲けのための浅はかな技術が、伝統と知恵を内包する地域社会を破壊することがないように。

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草刈

7/13〜14

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草刈前のクリ園
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草刈後のクリ園

  いやはや暑かった。2日とも34℃を超す酷暑、気象庁のいう気温は、百葉箱すなわち地上1.5 mの日陰の気温である。真昼の最も暑い時間、少しでも涼しいところでの作業にしようと山のクリ畑での草刈を行った。標高が200 mほどあるので、理論的に考えれば気温は1.5〜2℃程度は低いはずだが、そううまくいく筈もない。まず麦わら帽子を目深にかぶり、乗用草刈り機で刈り始めた。体を動かすより楽ではないかという甘い考えで始めたのだが、すこし動くと後ろにあるエンジンの熱気がもろに伝わってくる。私の草刈機は海外向け仕様であるため、オイルクーラーが付いているのだが、真夏のオイルクーラーはオイルヒーターである。背中に遠赤外線ヒーターを背負っているようなもので、1時間ほどで音を上げてしまった。草を切る高さは最高にセットしているのだが、凹凸でどうしても土壌表面を削ることになる。風向きによっては排気ガスと土埃を一緒に吸い込まざるを得ない。

  結局予定の半分ほどで切り上げ、後はエンジン付き草刈機で法面の草刈に切り替えた。この作業も日向ではひたすら暑い。日陰に入ると間髪を入れずヤブ蚊が襲来する。網付きの帽子をかぶっての作業で、自分の呼気がこもって暑い。体調と相談しながらの2日間で、園の外周の草刈は終わった。園内の草刈はもう1日必要である。

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